Kabupaten Alor secara geografis terletak di antara 125°48″ -123°48″ BT dan antara 8°6″-8°36″ LS. Kabupaten ini berada di wilayah timur laut provinsi Nusa Tenggara Timur yang berbatasan langsung dengan :
| Utara | Laut Flores |
| Timur | Wilayah Kabupaten Maluku Barat Daya |
| Selatan | Selat Ombay dan Timor Leste |
| Barat | Selat Lomblen dan Kabupaten Lembata |
Wilayah Kabupaten Alor adalah wilayah kepulauan yang terdiri dari 20 pulau.
9 pulau telah dihuni penduduk : pulau Alor, pulau Pantar, pulau Pura, pulau Tereweng, pulau Ternate, pulau Kepa, pulau Buaya, pulau Kangge dan pulau Kura.
11 pulau lainnya tidak berpenghuni : pulau Sikka, pulau Kapas, pulau Batang, pulau Lapang, pulau Rusa, pulau Kambing, pulau Watu Manu, pulau Batu Bawa, pulau Batu Ille, pulau Ikan Ruing dan pulau Nubu.
Luas wilayah yang dimiliki Kabupaten Alor adalah 2.928,88 km²
Topografi
Topografi Kabupaten Alor adalah merupakan konfigurasi wilayah daratan yang bergunung dan berbukit dengan iklim yang variatif sehingga cocok untuk pengembangan aneka komoditi pertanian, tanaman pangan, perkebunan, kehutanan dan peternakan. Keadaan topografi wilayah Kabupaten Alor adalah:
- Kemiringan di atas 40 derajat: 64,25%
- Kemiringan 15–40 derajat: 25,61%
- Kemiringan 3–15 derajat: 8,69%
- Kemiringan 0–3 derajat: 3,45%
Jenis tanah di Kabupaten Alor temasuk Vulkanik muda sehingga kaya unsur hara dengan struktur tanah yang gembur dan subur. Solum tanah sedang sampai dalam, sehingga tanah lebih stabil dengan kemampuan menahan air tinggi dan dapat diusahakan berbagai jenis tanaman. Kondisi geografi Kabupaten Alor berkonfigurasi bergunung-gunung dan memberikan variasi iklim yang berbeda dan sangat menguntungkan bagi daerah dan rakyat dalam pengembangan tanaman produksi.
Iklim
Seluruh wilayah Kabupaten Alor masuk dalam kategori iklim sabana tropis. Dalam jangka waktu setahun, durasi musim penghujan berlangsung relatif cukup singkat, yakni dari bulan Desember hingga bulan Maret, sedangkan musim kemarau mempunyai periode yang cukup panjang yakni ≥7 bulan. Oleh karena iklimnya yang cukup kering, periode hari hujan per satu bulannya biasanya ≤20 hari. Suhu udara di wilayah Kabupaten Alor berkisar antara 21°–33 °C dengan tingkat kelembapan nisbi sebesar ±74%.